Mis à jour le 19.10.2022
100 000. C’est le nombre de génomes séquencés pour suivre la pandémie de Covid-19 en Afrique. Un chiffre remarquable, qui traduit une augmentation majeure rendue possible par des investissements dans le séquençage. Cette étude de surveillance génomique confirme la nature hétérogène de la pandémie et met en lumière la dynamique de dispersion distincte des variants préoccupants, en particulier Alpha, Beta, Delta et Omicron, sur le continent.
Dans une publication parue dans Science, les scientifiques montrent une augmentation du nombre de pays africains capables de séquencer localement, et soulignent que le séquençage local permet un délai d'exécution plus rapide et une surveillance de routine plus régulière. Parmi les plus de 400 auteurs signataires figurent Alpha K. Keita, directeur adjoint du Centre de recherche et de formation en infectiologie de Guinée (Cerfig) et chercheur de l’UMR TransVIHMI, et plus de 40 scientifiques membres d’organismes partenairesCentre MURAZ, Ouagadougou, Burkina Faso ; National Institute of Public Health of Burkina Faso (INSP/BF), Ouagadougou, Burkina Faso ; Bacteriology and Virology Department Souro Sanou University Hospital, Bobo-Dioulasso, Burkina Faso ; Centre Pasteur of Cameroun, Yaounde, Cameroon ; West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens (WACCBIP), College of Basic and Applied Sciences, University of Ghana, Accra, Ghana ; Noguchi Memorial Institute for Medical Research, University of Ghana, Legon, Ghana ; Centre de Recherche et de Formation en Infectiologie de Guinée (CERFIG), Université de Conakry, Conakry, Guinea ; Institut Pasteur de Dakar, Dakar, Senegal ; Institut Pasteur de Madagascar, Antananarivo, Madagascar ; Institut Pasteur de Bangui, Bangui, Central African Republic ; Institut Pasteur de Côte d’Ivoire ; Institut Pasteur de Guinée, Conakry, Guinea ; Center for Medical and Sanitary Research (CERMES), Niamey, Niger ; Institut National de Recherche Biomédicale (INRB), Kinshasa, the Democratic Republic of the Congo ; Laboratoire Biolim FSS/Université de Lomé, Lomé, Togo1 d’Afroscreen.
Financé dans le cadre de l’initiative Santé en commun mise en œuvre par l’AFD, Afroscreen a été conçu par l’IRD, l’ANRS et l’Institut Pasteur. Avec l’objectif premier de constituer un programme de riposte contre la Covid-19 pour renforcer la surveillance de l’évolution des variants dans 13 pays d’Afrique, Afroscreen a depuis étendu son champs d’action au-delà de Sars-CoV2.
